Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES0005 Pepper.v.1.5.chr02 114834780 2e-38
CaES0021 Pepper.v.1.5.chr02 126883181 1e-76
CaES0031 Pepper.v.1.5.chr02 104798242 4e-38
CaES0053 Pepper.v.1.5.chr02 152827631 1e-121
CaES0057 Pepper.v.1.5.chr02 151151550 1e-129
CaES0078 Pepper.v.1.5.chr02 156600820 1e-125
CaES0119 Pepper.v.1.5.chr02 139466366 3e-74
CaES0122 Pepper.v.1.5.chr02 151606115 1e-131
CaES0123 Pepper.v.1.5.chr02 152318974 6e-92
CaES0127 Pepper.v.1.5.chr02 151199058 8e-66
CaES0142 Pepper.v.1.5.chr02 141480349 1e-102
CaES0159 Pepper.v.1.5.chr02 145818079 6e-79
CaES0166 Pepper.v.1.5.chr02 146250469 4e-42
CaES0170 Pepper.v.1.5.chr02 152834527 1e-45
CaES0179 Pepper.v.1.5.chr02 92892616 1e-110
CaES0184 Pepper.v.1.5.chr02 162661312 1e-103
CaES0189 Pepper.v.1.5.chr02 133506115 2e-45
CaES0196 Pepper.v.1.5.chr02 12762453 1e-115
CaES0208 Pepper.v.1.5.chr02 2504915 1e-145
CaES0211 Pepper.v.1.5.chr02 132225725 1e-100
CaES0215 Pepper.v.1.5.chr02 67353199 8e-26
CaES0246 Pepper.v.1.5.chr02 149215127 1e-31
CaES0251 Pepper.v.1.5.chr02 73184915 4e-61
CaES0254 Pepper.v.1.5.chr02 143044559 2e-81
CaES0267 Pepper.v.1.5.chr02 141923614 2e-95
CaES0279 Pepper.v.1.5.chr02 150334096 1e-101
CaES0281 Pepper.v.1.5.chr02 158785452 1e-120
CaES0285 Pepper.v.1.5.chr02 132010261 1e-38
CaES0298 Pepper.v.1.5.chr02 122816180 1e-106
CaES0303 Pepper.v.1.5.chr02 109597300 1e-144
CaES0310 Pepper.v.1.5.chr02 131161202 4e-60
CaES0313 Pepper.v.1.5.chr02 145322114 1e-117
CaES0317 Pepper.v.1.5.chr02 62768050 1e-145
CaES0344 Pepper.v.1.5.chr02 136531099 4e-92
CaES0362 Pepper.v.1.5.chr02 150396201 1e-141
CaES0367 Pepper.v.1.5.chr02 117240011 8e-31
CaES0380 Pepper.v.1.5.chr02 161182294 1e-124
CaES0386 Pepper.v.1.5.chr02 151816063 1e-117
CaES0402 Pepper.v.1.5.chr02 158333953 1e-117
CaES0410 Pepper.v.1.5.chr02 125170765 1e-120
CaES0422 Pepper.v.1.5.chr02 158718226 1e-121
CaES0425 0.35 192 Pepper.v.1.5.chr02 40498773 1e-92
CaES0428 Pepper.v.1.5.chr02 141433244 8e-82
CaES0430 Pepper.v.1.5.chr02 155445757 1e-127
CaES0451 Pepper.v.1.5.chr02 158917605 8e-61
CaES0453 Pepper.v.1.5.chr02 119871679 1e-102
CaES0467 Pepper.v.1.5.chr02 150400301 1e-150
CaES0472 Pepper.v.1.5.chr02 146189016 1e-59
CaES0480 Pepper.v.1.5.chr02 124245299 1e-130
CaES0496 Pepper.v.1.5.chr02 142279513 3e-33
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549

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