Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4216 Pepper.v.1.5.chr02 144093868 2e-56
CaES4257 Pepper.v.1.5.chr02 71177471 1e-115
CaES4268 Pepper.v.1.5.chr02 163463743 1e-133
CaES4294 Pepper.v.1.5.chr02 116630028 1e-123
CaES4295 Pepper.v.1.5.chr02 164822904 1e-127
CaES4296 Pepper.v.1.5.chr02 137974622 3e-59
CaES4299 Pepper.v.1.5.chr02 126989469 1e-139
CaES4307 Pepper.v.1.5.chr02 157446516 1e-137
CaES4314 Pepper.v.1.5.chr02 162462130 1e-149
CaES4315 Pepper.v.1.5.chr02 144362998 1e-109
CaES4316 Pepper.v.1.5.chr02 141515030 1e-106
CaES4321 Pepper.v.1.5.chr02 141588043 1e-128
CaES4335 Pepper.v.1.5.chr02 158981729 3e-61
CaES4339 Pepper.v.1.5.chr02 105050958 2e-54
CaES4350 Pepper.v.1.5.chr02 163987947 1e-128
CaES4354 Pepper.v.1.5.chr02 151771758 2e-97
CaES4378 Pepper.v.1.5.chr02 137961962 6e-81
CaES4401 Pepper.v.1.5.chr02 145266037 2e-82
CaES4406 Pepper.v.1.5.chr02 155464879 1e-154
CaES4462 Pepper.v.1.5.chr02 89200157 1e-95
CaES4472 Pepper.v.1.5.chr02 164782264 1e-117
CaES4484 Pepper.v.1.5.chr02 139059646 1e-44
CaES4487 Pepper.v.1.5.chr02 42211173 9e-36
CaES4490 Pepper.v.1.5.chr02 161694831 1e-109
CaES4510 Pepper.v.1.5.chr02 3668064 3e-89
CaES4516 Pepper.v.1.5.chr02 165168019 1e-132
CaES4521 Pepper.v.1.5.chr02 137894066 1e-100
CaES4524 Pepper.v.1.5.chr02 165033805 1e-146
CaES4549 Pepper.v.1.5.chr02 121715893 1e-129
CaES4553 Pepper.v.1.5.chr02 113774826 9e-42
CaES4572 Pepper.v.1.5.chr02 70771160 2e-74
CaES4593 Pepper.v.1.5.chr02 133738363 1e-114
CaES4595 Pepper.v.1.5.chr02 124136999 4e-87
CaES4608 Pepper.v.1.5.chr02 123166645 1e-137
CaES4622 Pepper.v.1.5.chr02 3668064 8e-78
CaES4639 Pepper.v.1.5.chr02 164599066 1e-136
CaES4655 Pepper.v.1.5.chr02 139154436 1e-151
CaES4658 Pepper.v.1.5.chr02 160086924 1e-119
CaES4659 Pepper.v.1.5.chr02 142323583 1e-124
CaES4683 Pepper.v.1.5.chr02 160303342 1e-67
CaES4686 Pepper.v.1.5.chr02 134861882 6e-23
CaES4689 Pepper.v.1.5.chr02 155697938 1e-113
CaES4695 Pepper.v.1.5.chr02 118774190 1e-136
CaES4701 Pepper.v.1.5.chr02 146500087 1e-110
CaES4706 Pepper.v.1.5.chr02 131831895 8e-87
CaES4710 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr02 146793182 1e-100
CaES4726 Pepper.v.1.5.chr02 157651263 1e-119
CaES4727 Pepper.v.1.5.chr02 156200228 1e-117
CaES4738 Pepper.v.1.5.chr02 150322774 1e-130
CaES4742 Pepper.v.1.5.chr02 155488117 2e-55
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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