Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES3832 Pepper.v.1.5.chr02 134655730 8e-99
CaES3837 Pepper.v.1.5.chr02 165884485 8e-83
CaES3849 Pepper.v.1.5.chr02 77462863 1e-117
CaES3854 Pepper.v.1.5.chr02 155233747 1e-128
CaES3857 Pepper.v.1.5.chr02 4529170 2e-25
CaES3872 Pepper.v.1.5.chr02 108096900 2e-92
CaES3879 Pepper.v.1.5.chr02 122859875 6e-72
CaES3895 Pepper.v.1.5.chr02 165354269 1e-114
CaES3897 Pepper.v.1.5.chr02 28738709 2e-62
CaES3924 Pepper.v.1.5.chr02 131256339 1e-121
CaES3927 Pepper.v.1.5.chr02 105792792 7e-75
CaES3941 Pepper.v.1.5.chr02 152695483 8e-84
CaES3956 Pepper.v.1.5.chr02 140162165 7e-87
CaES3958 0.367 192 Pepper.v.1.5.chr02 158333086 2e-28
CaES3959 Pepper.v.1.5.chr02 123083186 1e-131
CaES3960 Pepper.v.1.5.chr02 164004339 5e-99
CaES3964 Pepper.v.1.5.chr02 150609318 1e-130
CaES3967 Pepper.v.1.5.chr02 156607140 1e-126
CaES3974 Pepper.v.1.5.chr02 49799882 1e-115
CaES3977 Pepper.v.1.5.chr02 70731440 1e-93
CaES3978 Pepper.v.1.5.chr02 152847126 1e-169
CaES3982 Pepper.v.1.5.chr02 150227607 4e-21
CaES3984 Pepper.v.1.5.chr02 67303077 5e-86
CaES3987 Pepper.v.1.5.chr02 108828454 1e-50
CaES4007 Pepper.v.1.5.chr02 152318289 1e-115
CaES4012 Pepper.v.1.5.chr02 165599762 9e-43
CaES4027 Pepper.v.1.5.chr02 161973988 1e-130
CaES4048 Pepper.v.1.5.chr02 164887205 2e-68
CaES4056 Pepper.v.1.5.chr02 160777470 8e-65
CaES4086 Pepper.v.1.5.chr02 145853998 1e-137
CaES4087 Pepper.v.1.5.chr02 163204520 1e-145
CaES4091 Pepper.v.1.5.chr02 33201776 1e-127
CaES4109 Pepper.v.1.5.chr02 19086840 1e-114
CaES4111 Pepper.v.1.5.chr02 150608405 7e-85
CaES4116 Pepper.v.1.5.chr02 118644078 1e-93
CaES4129 Pepper.v.1.5.chr02 162864867 2e-58
CaES4132 Pepper.v.1.5.chr02 159068647 1e-144
CaES4136 Pepper.v.1.5.chr02 158408232 1e-110
CaES4137 Pepper.v.1.5.chr02 160684400 1e-127
CaES4138 Pepper.v.1.5.chr02 4533155 1e-81
CaES4140 Pepper.v.1.5.chr02 137123552 1e-127
CaES4159 Pepper.v.1.5.chr02 163972125 1e-126
CaES4160 Pepper.v.1.5.chr02 60788041 3e-66
CaES4172 Pepper.v.1.5.chr02 26595219 6e-70
CaES4186 Pepper.v.1.5.chr02 160769376 1e-130
CaES4195 Pepper.v.1.5.chr02 77056668 2e-28
CaES4197 Pepper.v.1.5.chr02 137977715 1e-125
CaES4211 Pepper.v.1.5.chr02 147868452 1e-119
CaES4213 Pepper.v.1.5.chr02 62626379 6e-82
CaES4215 Pepper.v.1.5.chr02 140591924 1e-131
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549

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