Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3127 Pepper.v.1.5.chr02 126938450 1e-141
CaES3143 Pepper.v.1.5.chr02 156841471 1e-144
CaES3207 Pepper.v.1.5.chr02 162684709 5e-54
CaES3213 Pepper.v.1.5.chr02 148634165 9e-79
CaES3219 Pepper.v.1.5.chr02 159620485 5e-85
CaES3254 Pepper.v.1.5.chr02 155532864 1e-110
CaES3264 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr02 138395063 2e-96
CaES3286 Pepper.v.1.5.chr02 162225016 1e-112
CaES3303 Pepper.v.1.5.chr02 19487613 1e-40
CaES3344 Pepper.v.1.5.chr02 119363653 1e-133
CaES3354 Pepper.v.1.5.chr02 163591382 1e-138
CaES3382 Pepper.v.1.5.chr02 163150001 1e-151
CaES3385 Pepper.v.1.5.chr02 52238312 1e-119
CaES3422 Pepper.v.1.5.chr02 159766264 1e-124
CaES3424 Pepper.v.1.5.chr02 152861487 1e-110
CaES3443 Pepper.v.1.5.chr02 160673926 1e-133
CaES3444 Pepper.v.1.5.chr02 153643132 1e-145
CaES3459 Pepper.v.1.5.chr02 12762453 1e-115
CaES3461 Pepper.v.1.5.chr02 156411978 1e-112
CaES3468 Pepper.v.1.5.chr02 161860340 3e-67
CaES3482 Pepper.v.1.5.chr02 132241459 1e-136
CaES3492 Pepper.v.1.5.chr02 156379874 5e-46
CaES3496 Pepper.v.1.5.chr02 160374326 3e-97
CaES3533 Pepper.v.1.5.chr02 151081087 1e-39
CaES3544 Pepper.v.1.5.chr02 124371880 1e-160
CaES3547 Pepper.v.1.5.chr02 5863289 1e-136
CaES3557 Pepper.v.1.5.chr02 147243316 1e-113
CaES3560 Pepper.v.1.5.chr02 28871429 1e-123
CaES3568 Pepper.v.1.5.chr02 160474565 1e-127
CaES3578 Pepper.v.1.5.chr02 165716872 5e-76
CaES3601 Pepper.v.1.5.chr02 150971143 1e-111
CaES3617 Pepper.v.1.5.chr02 138058952 1e-121
CaES3638 Pepper.v.1.5.chr02 163589923 4e-82
CaES3662 Pepper.v.1.5.chr02 14053301 1e-144
CaES3664 Pepper.v.1.5.chr02 157730565 1e-106
CaES3666 Pepper.v.1.5.chr02 165885625 1e-160
CaES3681 Pepper.v.1.5.chr02 118774690 1e-101
CaES3704 Pepper.v.1.5.chr02 159172752 1e-119
CaES3708 Pepper.v.1.5.chr02 153938586 1e-117
CaES3733 Pepper.v.1.5.chr02 163548470 2e-98
CaES3756 Pepper.v.1.5.chr02 118644481 5e-94
CaES3762 Pepper.v.1.5.chr02 76536303 4e-24
CaES3767 Pepper.v.1.5.chr02 136382025 1e-137
CaES3768 Pepper.v.1.5.chr02 155942550 1e-104
CaES3780 Pepper.v.1.5.chr02 154025545 1e-132
CaES3783 Pepper.v.1.5.chr02 164514674 2e-68
CaES3787 Pepper.v.1.5.chr02 164306846 1e-51
CaES3788 Pepper.v.1.5.chr02 95574662 1e-142
CaES3805 Pepper.v.1.5.chr02 154901324 1e-112
CaES3825 Pepper.v.1.5.chr02 119673491 3e-26
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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