Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES4701 Pepper.v.1.5.chr02 146500087 1e-110
CaES4710 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr02 146793182 1e-100
CaES2989 Pepper.v.1.5.chr02 146855962 2e-83
CaES1031 Pepper.v.1.5.chr02 146873779 1e-104
CaES3557 Pepper.v.1.5.chr02 147243316 1e-113
CaES4211 Pepper.v.1.5.chr02 147868452 1e-119
CaES1002 Pepper.v.1.5.chr02 148109823 3e-87
CaES1661 Pepper.v.1.5.chr02 148558738 2e-82
CaES3213 Pepper.v.1.5.chr02 148634165 9e-79
CaES5659 Pepper.v.1.5.chr02 148634371 5e-93
CaES1138 Pepper.v.1.5.chr02 148711989 1e-102
CaES2748 Pepper.v.1.5.chr02 148797848 1e-143
CaES1484 Pepper.v.1.5.chr02 148939422 1e-106
CaES0246 Pepper.v.1.5.chr02 149215127 1e-31
CaES4908 Pepper.v.1.5.chr02 149655304 3e-87
CaES2450 Pepper.v.1.5.chr02 149735626 1e-125
CaES1663 Pepper.v.1.5.chr02 149786664 3e-99
CaES4870 Pepper.v.1.5.chr02 149787609 1e-114
CaES3101 Pepper.v.1.5.chr02 149965400 9e-53
CaES1754 Pepper.v.1.5.chr02 150028803 6e-87
CaES2971 Pepper.v.1.5.chr02 150136323 4e-91
CaES5427 Pepper.v.1.5.chr02 150137718 1e-85
CaES1808 Pepper.v.1.5.chr02 150205187 1e-117
CaES3982 Pepper.v.1.5.chr02 150227607 4e-21
CaES4738 Pepper.v.1.5.chr02 150322774 1e-130
CaES0279 Pepper.v.1.5.chr02 150334096 1e-101
CaES0725 Pepper.v.1.5.chr02 150364024 1e-117
CaES0362 Pepper.v.1.5.chr02 150396201 1e-141
CaES0467 Pepper.v.1.5.chr02 150400301 1e-150
CaES1294 Pepper.v.1.5.chr02 150443907 1e-112
CaES1997 Pepper.v.1.5.chr02 150603811 1e-117
CaES4111 Pepper.v.1.5.chr02 150608405 7e-85
CaES3964 Pepper.v.1.5.chr02 150609318 1e-130
CaES0536 Pepper.v.1.5.chr02 150829298 1e-93
CaES5519 Pepper.v.1.5.chr02 150854077 1e-91
CaES4941 Pepper.v.1.5.chr02 150959096 1e-129
CaES3601 Pepper.v.1.5.chr02 150971143 1e-111
CaES3533 Pepper.v.1.5.chr02 151081087 1e-39
CaES0057 Pepper.v.1.5.chr02 151151550 1e-129
CaES4978 Pepper.v.1.5.chr02 151185161 1e-107
CaES0127 Pepper.v.1.5.chr02 151199058 8e-66
CaES0824 Pepper.v.1.5.chr02 151278776 2e-78
CaES4951 Pepper.v.1.5.chr02 151295695 1e-105
CaES1041 Pepper.v.1.5.chr02 151297402 1e-141
CaES1345 Pepper.v.1.5.chr02 151297980 1e-82
CaES2981 Pepper.v.1.5.chr02 151310771 6e-83
CaES0684 Pepper.v.1.5.chr02 151451558 1e-112
CaES0122 Pepper.v.1.5.chr02 151606115 1e-131
CaES1763 Pepper.v.1.5.chr02 151624704 1e-117
CaES1121 Pepper.v.1.5.chr02 151751546 4e-93
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549

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