Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2657 Pepper.v.1.5.chr02 160230033 1e-36
CaES2664 Pepper.v.1.5.chr02 165083371 5e-99
CaES2670 Pepper.v.1.5.chr02 30085510 3e-62
CaES2695 Pepper.v.1.5.chr02 152272367 1e-118
CaES2711 Pepper.v.1.5.chr02 153286029 1e-142
CaES2718 Pepper.v.1.5.chr02 151772453 1e-140
CaES2732 Pepper.v.1.5.chr02 137394629 5e-91
CaES2738 Pepper.v.1.5.chr02 16905736 1e-152
CaES2741 Pepper.v.1.5.chr02 4530908 8e-92
CaES2742 Pepper.v.1.5.chr02 164529632 2e-46
CaES2748 Pepper.v.1.5.chr02 148797848 1e-143
CaES2794 Pepper.v.1.5.chr02 141190200 1e-145
CaES2807 Pepper.v.1.5.chr02 85393575 5e-31
CaES2809 Pepper.v.1.5.chr02 163771537 3e-58
CaES2811 Pepper.v.1.5.chr02 84489954 7e-68
CaES2836 Pepper.v.1.5.chr02 133739826 1e-133
CaES2839 Pepper.v.1.5.chr02 153824107 1e-133
CaES2840 Pepper.v.1.5.chr02 160058283 1e-138
CaES2846 Pepper.v.1.5.chr02 60400846 1e-120
CaES2859 Pepper.v.1.5.chr02 140674583 1e-125
CaES2864 Pepper.v.1.5.chr02 156069045 1e-132
CaES2870 Pepper.v.1.5.chr02 133337834 4e-43
CaES2894 Pepper.v.1.5.chr02 129785041 1e-133
CaES2898 Pepper.v.1.5.chr02 153089727 1e-130
CaES2903 Pepper.v.1.5.chr02 140420183 2e-34
CaES2904 Pepper.v.1.5.chr02 5933847 1e-110
CaES2907 Pepper.v.1.5.chr02 84659647 6e-68
CaES2911 Pepper.v.1.5.chr02 63294172 1e-129
CaES2920 0.081 191 Pepper.v.1.5.chr02 162496068 1e-125
CaES2928 Pepper.v.1.5.chr02 163783574 1e-151
CaES2932 Pepper.v.1.5.chr02 112689326 1e-130
CaES2938 Pepper.v.1.5.chr02 140277099 1e-115
CaES2940 Pepper.v.1.5.chr02 140441330 1e-106
CaES2949 Pepper.v.1.5.chr02 140913903 1e-101
CaES2971 Pepper.v.1.5.chr02 150136323 4e-91
CaES2972 Pepper.v.1.5.chr02 140415199 1e-105
CaES2981 Pepper.v.1.5.chr02 151310771 6e-83
CaES2989 Pepper.v.1.5.chr02 146855962 2e-83
CaES3005 Pepper.v.1.5.chr02 106807789 1e-126
CaES3014 Pepper.v.1.5.chr02 164462073 1e-118
CaES3029 Pepper.v.1.5.chr02 159174342 1e-141
CaES3044 Pepper.v.1.5.chr02 141949135 1e-144
CaES3046 Pepper.v.1.5.chr02 163463431 1e-110
CaES3087 Pepper.v.1.5.chr02 154411913 1e-137
CaES3088 Pepper.v.1.5.chr02 103911042 3e-62
CaES3095 Pepper.v.1.5.chr02 128621415 1e-108
CaES3101 Pepper.v.1.5.chr02 149965400 9e-53
CaES3103 Pepper.v.1.5.chr02 1084377 3e-93
CaES3120 Pepper.v.1.5.chr02 41593178 1e-146
CaES3124 Pepper.v.1.5.chr02 105032908 2e-57
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549

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