Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2439 Pepper.v.1.5.chr02 132900755 2e-99
CaES2870 Pepper.v.1.5.chr02 133337834 4e-43
CaES0189 Pepper.v.1.5.chr02 133506115 2e-45
CaES4593 Pepper.v.1.5.chr02 133738363 1e-114
CaES2836 Pepper.v.1.5.chr02 133739826 1e-133
CaES0957 Pepper.v.1.5.chr02 133828780 3e-78
CaES2436 Pepper.v.1.5.chr02 133857854 2e-50
CaES4836 Pepper.v.1.5.chr02 133901239 5e-44
CaES2226 Pepper.v.1.5.chr02 134064376 1e-167
CaES3832 Pepper.v.1.5.chr02 134655730 8e-99
CaES4686 Pepper.v.1.5.chr02 134861882 6e-23
CaES0998 Pepper.v.1.5.chr02 134901530 5e-47
CaES5446 Pepper.v.1.5.chr02 135232824 9e-35
CaES1936 Pepper.v.1.5.chr02 135272902 1e-150
CaES1297 Pepper.v.1.5.chr02 135322322 3e-36
CaES1877 Pepper.v.1.5.chr02 135447596 2e-63
CaES0587 Pepper.v.1.5.chr02 135566461 1e-89
CaES5033 Pepper.v.1.5.chr02 135566868 4e-34
CaES5595 Pepper.v.1.5.chr02 135688616 1e-90
CaES3767 Pepper.v.1.5.chr02 136382025 1e-137
CaES2374 Pepper.v.1.5.chr02 136494932 1e-102
CaES0344 Pepper.v.1.5.chr02 136531099 4e-92
CaES5119 Pepper.v.1.5.chr02 136909969 6e-85
CaES4140 Pepper.v.1.5.chr02 137123552 1e-127
CaES1229 Pepper.v.1.5.chr02 137244159 1e-93
CaES2732 Pepper.v.1.5.chr02 137394629 5e-91
CaES4521 Pepper.v.1.5.chr02 137894066 1e-100
CaES2200 Pepper.v.1.5.chr02 137916986 4e-24
CaES5395 Pepper.v.1.5.chr02 137942540 6e-81
CaES4378 Pepper.v.1.5.chr02 137961962 6e-81
CaES4296 Pepper.v.1.5.chr02 137974622 3e-59
CaES4197 Pepper.v.1.5.chr02 137977715 1e-125
CaES2579 Pepper.v.1.5.chr02 138057965 1e-156
CaES3617 Pepper.v.1.5.chr02 138058952 1e-121
CaES1765 Pepper.v.1.5.chr02 138408106 1e-106
CaES1652 Pepper.v.1.5.chr02 138427876 1e-116
CaES4484 Pepper.v.1.5.chr02 139059646 1e-44
CaES4655 Pepper.v.1.5.chr02 139154436 1e-151
CaES4920 Pepper.v.1.5.chr02 139455252 1e-120
CaES1070 Pepper.v.1.5.chr02 139458512 2e-99
CaES0119 Pepper.v.1.5.chr02 139466366 3e-74
CaES2443 Pepper.v.1.5.chr02 140113449 3e-84
CaES3956 Pepper.v.1.5.chr02 140162165 7e-87
CaES4837 Pepper.v.1.5.chr02 140180445 1e-108
CaES2938 Pepper.v.1.5.chr02 140277099 1e-115
CaES2563 Pepper.v.1.5.chr02 140318418 1e-111
CaES2972 Pepper.v.1.5.chr02 140415199 1e-105
CaES2903 Pepper.v.1.5.chr02 140420183 2e-34
CaES2940 Pepper.v.1.5.chr02 140441330 1e-106
CaES4215 Pepper.v.1.5.chr02 140591924 1e-131
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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