Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2150 Pepper.v.1.5.chr02 132263792 1e-119
CaES2164 Pepper.v.1.5.chr02 154696387 4e-85
CaES2193 Pepper.v.1.5.chr02 159410893 1e-111
CaES2200 Pepper.v.1.5.chr02 137916986 4e-24
CaES2203 Pepper.v.1.5.chr02 141570825 1e-23
CaES2226 Pepper.v.1.5.chr02 134064376 1e-167
CaES2233 Pepper.v.1.5.chr02 162216142 1e-146
CaES2235 Pepper.v.1.5.chr02 143397953 1e-136
CaES2272 Pepper.v.1.5.chr02 145938827 1e-82
CaES2285 Pepper.v.1.5.chr02 165885358 7e-83
CaES2304 Pepper.v.1.5.chr02 154597426 1e-83
CaES2311 Pepper.v.1.5.chr02 63292602 1e-119
CaES2330 Pepper.v.1.5.chr02 85122898 2e-84
CaES2334 Pepper.v.1.5.chr02 26858061 5e-47
CaES2343 Pepper.v.1.5.chr02 71937698 5e-39
CaES2346 Pepper.v.1.5.chr02 152616904 1e-102
CaES2349 Pepper.v.1.5.chr02 141482464 1e-87
CaES2359 Pepper.v.1.5.chr02 6332653 2e-89
CaES2374 Pepper.v.1.5.chr02 136494932 1e-102
CaES2390 Pepper.v.1.5.chr02 58587041 6e-47
CaES2406 Pepper.v.1.5.chr02 60081366 4e-98
CaES2411 Pepper.v.1.5.chr02 154413159 5e-87
CaES2417 Pepper.v.1.5.chr02 142756441 2e-50
CaES2421 Pepper.v.1.5.chr02 42641305 2e-80
CaES2435 Pepper.v.1.5.chr02 144003277 1e-100
CaES2436 Pepper.v.1.5.chr02 133857854 2e-50
CaES2439 Pepper.v.1.5.chr02 132900755 2e-99
CaES2443 Pepper.v.1.5.chr02 140113449 3e-84
CaES2450 Pepper.v.1.5.chr02 149735626 1e-125
CaES2489 0.005 192 Pepper.v.1.5.chr02 154045458 1e-58
CaES2499 Pepper.v.1.5.chr02 163821007 3e-59
CaES2502 Pepper.v.1.5.chr02 27541661 4e-34
CaES2506 Pepper.v.1.5.chr02 163267374 2e-89
CaES2510 Pepper.v.1.5.chr02 164004399 3e-37
CaES2520 Pepper.v.1.5.chr02 157648270 6e-76
CaES2523 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr02 5787482 4e-59
CaES2541 Pepper.v.1.5.chr02 163262354 2e-82
CaES2544 Pepper.v.1.5.chr02 164306975 4e-84
CaES2561 Pepper.v.1.5.chr02 153878489 1e-123
CaES2563 Pepper.v.1.5.chr02 140318418 1e-111
CaES2579 Pepper.v.1.5.chr02 138057965 1e-156
CaES2580 Pepper.v.1.5.chr02 120123853 1e-131
CaES2585 Pepper.v.1.5.chr02 54847421 1e-59
CaES2593 Pepper.v.1.5.chr02 156902996 2e-77
CaES2594 Pepper.v.1.5.chr02 143313112 1e-138
CaES2607 Pepper.v.1.5.chr02 141560622 1e-91
CaES2610 Pepper.v.1.5.chr02 140864941 3e-30
CaES2614 Pepper.v.1.5.chr02 132073786 1e-129
CaES2621 Pepper.v.1.5.chr02 160767763 1e-140
CaES2634 Pepper.v.1.5.chr02 114621463 5e-93
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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