Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES3756 Pepper.v.1.5.chr02 118644481 5e-94
CaES4695 Pepper.v.1.5.chr02 118774190 1e-136
CaES1212 Pepper.v.1.5.chr02 118774190 1e-136
CaES3681 Pepper.v.1.5.chr02 118774690 1e-101
CaES3344 Pepper.v.1.5.chr02 119363653 1e-133
CaES4785 Pepper.v.1.5.chr02 119364562 1e-93
CaES4767 Pepper.v.1.5.chr02 119464511 1e-131
CaES3825 Pepper.v.1.5.chr02 119673491 3e-26
CaES0453 Pepper.v.1.5.chr02 119871679 1e-102
CaES1648 Pepper.v.1.5.chr02 119871993 3e-69
CaES2580 Pepper.v.1.5.chr02 120123853 1e-131
CaES0889 Pepper.v.1.5.chr02 120502579 1e-138
CaES4885 Pepper.v.1.5.chr02 120836859 1e-114
CaES4845 Pepper.v.1.5.chr02 120852748 3e-62
CaES0548 Pepper.v.1.5.chr02 121074345 1e-143
CaES4549 Pepper.v.1.5.chr02 121715893 1e-129
CaES1632 Pepper.v.1.5.chr02 122068586 1e-104
CaES1366 Pepper.v.1.5.chr02 122219175 1e-153
CaES0298 Pepper.v.1.5.chr02 122816180 1e-106
CaES3879 Pepper.v.1.5.chr02 122859875 6e-72
CaES3959 Pepper.v.1.5.chr02 123083186 1e-131
CaES4608 Pepper.v.1.5.chr02 123166645 1e-137
CaES4900 Pepper.v.1.5.chr02 123601296 8e-89
CaES1739 Pepper.v.1.5.chr02 124136999 5e-93
CaES4595 Pepper.v.1.5.chr02 124136999 4e-87
CaES1430 Pepper.v.1.5.chr02 124155832 1e-137
CaES0480 Pepper.v.1.5.chr02 124245299 1e-130
CaES3544 Pepper.v.1.5.chr02 124371880 1e-160
CaES5721 Pepper.v.1.5.chr02 124372012 1e-129
CaES1012 Pepper.v.1.5.chr02 124468505 5e-60
CaES1148 Pepper.v.1.5.chr02 124792709 1e-114
CaES0410 Pepper.v.1.5.chr02 125170765 1e-120
CaES0021 Pepper.v.1.5.chr02 126883181 1e-76
CaES3127 Pepper.v.1.5.chr02 126938450 1e-141
CaES4299 Pepper.v.1.5.chr02 126989469 1e-139
CaES3095 Pepper.v.1.5.chr02 128621415 1e-108
CaES2894 Pepper.v.1.5.chr02 129785041 1e-133
CaES5467 Pepper.v.1.5.chr02 129992660 3e-70
CaES0310 Pepper.v.1.5.chr02 131161202 4e-60
CaES3924 Pepper.v.1.5.chr02 131256339 1e-121
CaES4886 Pepper.v.1.5.chr02 131767015 1e-133
CaES4706 Pepper.v.1.5.chr02 131831895 8e-87
CaES1243 Pepper.v.1.5.chr02 131913203 1e-123
CaES0285 Pepper.v.1.5.chr02 132010261 1e-38
CaES2614 Pepper.v.1.5.chr02 132073786 1e-129
CaES0593 Pepper.v.1.5.chr02 132092728 1e-110
CaES5534 Pepper.v.1.5.chr02 132198662 4e-39
CaES0211 Pepper.v.1.5.chr02 132225725 1e-100
CaES3482 Pepper.v.1.5.chr02 132241459 1e-136
CaES2150 Pepper.v.1.5.chr02 132263792 1e-119
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549

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