Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1675 Pepper.v.1.5.chr02 165557635 1e-111
CaES1687 Pepper.v.1.5.chr02 114466444 6e-24
CaES1692 Pepper.v.1.5.chr02 153602743 4e-70
CaES1695 Pepper.v.1.5.chr02 160456835 1e-129
CaES1698 Pepper.v.1.5.chr02 157680756 1e-116
CaES1713 Pepper.v.1.5.chr02 12871808 5e-85
CaES1737 Pepper.v.1.5.chr02 163295956 9e-64
CaES1739 Pepper.v.1.5.chr02 124136999 5e-93
CaES1740 Pepper.v.1.5.chr02 71937590 4e-52
CaES1743 Pepper.v.1.5.chr02 153284145 3e-25
CaES1746 Pepper.v.1.5.chr02 155025023 2e-52
CaES1748 Pepper.v.1.5.chr02 143175223 1e-135
CaES1749 Pepper.v.1.5.chr02 146167588 1e-106
CaES1753 Pepper.v.1.5.chr02 35825297 1e-54
CaES1754 Pepper.v.1.5.chr02 150028803 6e-87
CaES1755 Pepper.v.1.5.chr02 152737018 2e-72
CaES1763 Pepper.v.1.5.chr02 151624704 1e-117
CaES1765 Pepper.v.1.5.chr02 138408106 1e-106
CaES1770 Pepper.v.1.5.chr02 159798898 2e-50
CaES1781 Pepper.v.1.5.chr02 142093581 3e-29
CaES1801 Pepper.v.1.5.chr02 142010870 1e-121
CaES1804 Pepper.v.1.5.chr02 4247909 3e-63
CaES1808 Pepper.v.1.5.chr02 150205187 1e-117
CaES1816 Pepper.v.1.5.chr02 160302759 1e-110
CaES1818 Pepper.v.1.5.chr02 60179284 1e-148
CaES1824 Pepper.v.1.5.chr02 46684172 1e-104
CaES1852 Pepper.v.1.5.chr02 161478644 1e-118
CaES1867 Pepper.v.1.5.chr02 56298217 1e-116
CaES1877 Pepper.v.1.5.chr02 135447596 2e-63
CaES1885 Pepper.v.1.5.chr02 70709670 5e-69
CaES1898 Pepper.v.1.5.chr02 155975212 1e-118
CaES1913 Pepper.v.1.5.chr02 160832633 1e-119
CaES1920 Pepper.v.1.5.chr02 60777377 1e-124
CaES1930 Pepper.v.1.5.chr02 14027393 1e-127
CaES1936 Pepper.v.1.5.chr02 135272902 1e-150
CaES1973 Pepper.v.1.5.chr02 102875810 1e-149
CaES1994 Pepper.v.1.5.chr02 26272592 2e-39
CaES1997 Pepper.v.1.5.chr02 150603811 1e-117
CaES2000 Pepper.v.1.5.chr02 154391899 2e-83
CaES2003 Pepper.v.1.5.chr02 155383231 4e-75
CaES2016 Pepper.v.1.5.chr02 146434262 2e-49
CaES2035 Pepper.v.1.5.chr02 141327234 1e-106
CaES2037 Pepper.v.1.5.chr02 164533128 1e-60
CaES2047 Pepper.v.1.5.chr02 141912019 1e-30
CaES2062 Pepper.v.1.5.chr02 2179652 1e-105
CaES2064 Pepper.v.1.5.chr02 82762802 3e-51
CaES2103 Pepper.v.1.5.chr02 144147744 1e-130
CaES2128 Pepper.v.1.5.chr02 157777611 6e-57
CaES2136 Pepper.v.1.5.chr02 162751493 1e-147
CaES2141 Pepper.v.1.5.chr02 157779935 1e-109
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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