Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES1095 Pepper.v.1.5.chr02 118644481 1e-81
CaES1110 Pepper.v.1.5.chr02 109603137 1e-102
CaES1112 0.499 190 Pepper.v.1.5.chr02 48575080 2e-72
CaES1121 Pepper.v.1.5.chr02 151751546 4e-93
CaES1125 Pepper.v.1.5.chr02 158993207 1e-104
CaES1131 Pepper.v.1.5.chr02 165822048 1e-117
CaES1137 0.236 190 Pepper.v.1.5.chr02 67587845 6e-83
CaES1138 Pepper.v.1.5.chr02 148711989 1e-102
CaES1148 Pepper.v.1.5.chr02 124792709 1e-114
CaES1159 Pepper.v.1.5.chr02 162445897 1e-118
CaES1169 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr02 9067531 7e-78
CaES1208 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr02 102585278 1e-125
CaES1212 Pepper.v.1.5.chr02 118774190 1e-136
CaES1218 Pepper.v.1.5.chr02 164545220 4e-41
CaES1229 Pepper.v.1.5.chr02 137244159 1e-93
CaES1243 Pepper.v.1.5.chr02 131913203 1e-123
CaES1246 Pepper.v.1.5.chr02 144147711 1e-143
CaES1249 Pepper.v.1.5.chr02 140866253 1e-93
CaES1252 Pepper.v.1.5.chr02 46697685 8e-62
CaES1258 Pepper.v.1.5.chr02 159975756 1e-110
CaES1288 Pepper.v.1.5.chr02 112027394 1e-117
CaES1294 Pepper.v.1.5.chr02 150443907 1e-112
CaES1297 Pepper.v.1.5.chr02 135322322 3e-36
CaES1332 Pepper.v.1.5.chr02 33443013 4e-86
CaES1336 Pepper.v.1.5.chr02 143180609 1e-94
CaES1339 Pepper.v.1.5.chr02 152640826 2e-90
CaES1345 Pepper.v.1.5.chr02 151297980 1e-82
CaES1356 Pepper.v.1.5.chr02 96676824 1e-90
CaES1366 Pepper.v.1.5.chr02 122219175 1e-153
CaES1395 Pepper.v.1.5.chr02 113026335 8e-48
CaES1415 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr02 52333354 1e-128
CaES1430 Pepper.v.1.5.chr02 124155832 1e-137
CaES1447 Pepper.v.1.5.chr02 155982864 1e-113
CaES1455 Pepper.v.1.5.chr02 140826439 5e-51
CaES1460 Pepper.v.1.5.chr02 17807141 2e-45
CaES1479 Pepper.v.1.5.chr02 163594642 5e-64
CaES1484 Pepper.v.1.5.chr02 148939422 1e-106
CaES1501 Pepper.v.1.5.chr02 161643608 1e-114
CaES1511 Pepper.v.1.5.chr02 153090100 1e-124
CaES1553 Pepper.v.1.5.chr02 52882127 9e-26
CaES1556 Pepper.v.1.5.chr02 157899339 4e-84
CaES1589 Pepper.v.1.5.chr02 118644292 6e-66
CaES1632 Pepper.v.1.5.chr02 122068586 1e-104
CaES1637 Pepper.v.1.5.chr02 141912224 2e-95
CaES1638 Pepper.v.1.5.chr02 164190200 9e-24
CaES1648 Pepper.v.1.5.chr02 119871993 3e-69
CaES1652 Pepper.v.1.5.chr02 138427876 1e-116
CaES1661 Pepper.v.1.5.chr02 148558738 2e-82
CaES1663 Pepper.v.1.5.chr02 149786664 3e-99
CaES1672 Pepper.v.1.5.chr02 85620682 1e-83
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549

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