Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2330 Pepper.v.1.5.chr02 85122898 2e-84
CaES2807 Pepper.v.1.5.chr02 85393575 5e-31
CaES1672 Pepper.v.1.5.chr02 85620682 1e-83
CaES5161 Pepper.v.1.5.chr02 85620682 1e-98
CaES4462 Pepper.v.1.5.chr02 89200157 1e-95
CaES0878 Pepper.v.1.5.chr02 90219119 1e-115
CaES0179 Pepper.v.1.5.chr02 92892616 1e-110
CaES3788 Pepper.v.1.5.chr02 95574662 1e-142
CaES1356 Pepper.v.1.5.chr02 96676824 1e-90
CaES0581 Pepper.v.1.5.chr02 97378763 1e-124
CaES5730 Pepper.v.1.5.chr02 101885212 3e-23
CaES5581 Pepper.v.1.5.chr02 102315790 8e-92
CaES1208 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr02 102585278 1e-125
CaES1973 Pepper.v.1.5.chr02 102875810 1e-149
CaES3088 Pepper.v.1.5.chr02 103911042 3e-62
CaES0031 Pepper.v.1.5.chr02 104798242 4e-38
CaES3124 Pepper.v.1.5.chr02 105032908 2e-57
CaES4339 Pepper.v.1.5.chr02 105050958 2e-54
CaES3927 Pepper.v.1.5.chr02 105792792 7e-75
CaES3005 Pepper.v.1.5.chr02 106807789 1e-126
CaES0629 Pepper.v.1.5.chr02 107441225 1e-83
CaES5563 Pepper.v.1.5.chr02 108088042 4e-81
CaES3872 Pepper.v.1.5.chr02 108096900 2e-92
CaES5177 Pepper.v.1.5.chr02 108238112 1e-113
CaES1077 Pepper.v.1.5.chr02 108459673 1e-89
CaES3987 Pepper.v.1.5.chr02 108828454 1e-50
CaES0303 Pepper.v.1.5.chr02 109597300 1e-144
CaES1110 Pepper.v.1.5.chr02 109603137 1e-102
CaES4843 Pepper.v.1.5.chr02 110015794 5e-45
CaES1288 Pepper.v.1.5.chr02 112027394 1e-117
CaES2932 Pepper.v.1.5.chr02 112689326 1e-130
CaES1395 Pepper.v.1.5.chr02 113026335 8e-48
CaES4748 Pepper.v.1.5.chr02 113274069 8e-54
CaES4553 Pepper.v.1.5.chr02 113774826 9e-42
CaES1687 Pepper.v.1.5.chr02 114466444 6e-24
CaES2634 Pepper.v.1.5.chr02 114621463 5e-93
CaES0005 Pepper.v.1.5.chr02 114834780 2e-38
CaES5482 Pepper.v.1.5.chr02 115145414 1e-107
CaES4294 Pepper.v.1.5.chr02 116630028 1e-123
CaES0797 Pepper.v.1.5.chr02 116635369 2e-94
CaES0367 Pepper.v.1.5.chr02 117240011 8e-31
CaES0616 Pepper.v.1.5.chr02 117581664 1e-85
CaES4116 Pepper.v.1.5.chr02 118644078 1e-93
CaES1589 Pepper.v.1.5.chr02 118644292 6e-66
CaES1095 Pepper.v.1.5.chr02 118644481 1e-81
CaES3756 Pepper.v.1.5.chr02 118644481 5e-94
CaES4695 Pepper.v.1.5.chr02 118774190 1e-136
CaES1212 Pepper.v.1.5.chr02 118774190 1e-136
CaES3681 Pepper.v.1.5.chr02 118774690 1e-101
CaES3344 Pepper.v.1.5.chr02 119363653 1e-133
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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