Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES0528 Pepper.v.1.5.chr02 33442786 7e-46
CaES0536 Pepper.v.1.5.chr02 150829298 1e-93
CaES0537 Pepper.v.1.5.chr02 164578802 1e-115
CaES0548 Pepper.v.1.5.chr02 121074345 1e-143
CaES0578 Pepper.v.1.5.chr02 154057349 3e-63
CaES0581 Pepper.v.1.5.chr02 97378763 1e-124
CaES0583 Pepper.v.1.5.chr02 145387730 1e-137
CaES0586 Pepper.v.1.5.chr02 164724649 1e-145
CaES0587 Pepper.v.1.5.chr02 135566461 1e-89
CaES0593 Pepper.v.1.5.chr02 132092728 1e-110
CaES0601 Pepper.v.1.5.chr02 159202713 1e-136
CaES0616 Pepper.v.1.5.chr02 117581664 1e-85
CaES0629 Pepper.v.1.5.chr02 107441225 1e-83
CaES0631 Pepper.v.1.5.chr02 5717113 1e-137
CaES0635 Pepper.v.1.5.chr02 160203350 3e-91
CaES0640 Pepper.v.1.5.chr02 60081629 7e-48
CaES0684 Pepper.v.1.5.chr02 151451558 1e-112
CaES0685 Pepper.v.1.5.chr02 140865772 5e-38
CaES0716 Pepper.v.1.5.chr02 25641510 1e-120
CaES0725 Pepper.v.1.5.chr02 150364024 1e-117
CaES0727 Pepper.v.1.5.chr02 165790238 1e-118
CaES0767 Pepper.v.1.5.chr02 12762453 1e-106
CaES0786 Pepper.v.1.5.chr02 161860340 1e-49
CaES0797 Pepper.v.1.5.chr02 116635369 2e-94
CaES0801 Pepper.v.1.5.chr02 165224612 1e-139
CaES0806 Pepper.v.1.5.chr02 60563487 1e-132
CaES0824 Pepper.v.1.5.chr02 151278776 2e-78
CaES0827 Pepper.v.1.5.chr02 144985407 2e-84
CaES0859 Pepper.v.1.5.chr02 165732074 1e-107
CaES0871 Pepper.v.1.5.chr02 157534125 4e-69
CaES0873 Pepper.v.1.5.chr02 157976887 1e-158
CaES0878 Pepper.v.1.5.chr02 90219119 1e-115
CaES0887 Pepper.v.1.5.chr02 141515556 1e-133
CaES0889 Pepper.v.1.5.chr02 120502579 1e-138
CaES0908 Pepper.v.1.5.chr02 79404284 5e-99
CaES0948 Pepper.v.1.5.chr02 23523135 1e-94
CaES0957 Pepper.v.1.5.chr02 133828780 3e-78
CaES0970 Pepper.v.1.5.chr02 164566168 1e-129
CaES0998 Pepper.v.1.5.chr02 134901530 5e-47
CaES1002 Pepper.v.1.5.chr02 148109823 3e-87
CaES1004 Pepper.v.1.5.chr02 158121009 1e-115
CaES1012 Pepper.v.1.5.chr02 124468505 5e-60
CaES1031 Pepper.v.1.5.chr02 146873779 1e-104
CaES1035 Pepper.v.1.5.chr02 15935297 1e-120
CaES1037 Pepper.v.1.5.chr02 73116747 4e-47
CaES1041 Pepper.v.1.5.chr02 151297402 1e-141
CaES1068 Pepper.v.1.5.chr02 2560059 1e-127
CaES1070 Pepper.v.1.5.chr02 139458512 2e-99
CaES1077 Pepper.v.1.5.chr02 108459673 1e-89
CaES1087 Pepper.v.1.5.chr02 160083728 1e-138
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549

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