Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES4748 Pepper.v.1.5.chr02 113274069 8e-54
CaES4767 Pepper.v.1.5.chr02 119464511 1e-131
CaES4774 Pepper.v.1.5.chr02 60180840 4e-95
CaES4785 Pepper.v.1.5.chr02 119364562 1e-93
CaES4794 Pepper.v.1.5.chr02 46401665 1e-125
CaES4799 Pepper.v.1.5.chr02 152215413 2e-70
CaES4801 Pepper.v.1.5.chr02 4335012 2e-38
CaES4836 Pepper.v.1.5.chr02 133901239 5e-44
CaES4837 Pepper.v.1.5.chr02 140180445 1e-108
CaES4843 Pepper.v.1.5.chr02 110015794 5e-45
CaES4845 Pepper.v.1.5.chr02 120852748 3e-62
CaES4850 Pepper.v.1.5.chr02 156413368 1e-128
CaES4852 Pepper.v.1.5.chr02 158621386 7e-81
CaES4867 Pepper.v.1.5.chr02 156145598 7e-46
CaES4870 Pepper.v.1.5.chr02 149787609 1e-114
CaES4873 Pepper.v.1.5.chr02 159499333 1e-125
CaES4879 Pepper.v.1.5.chr02 82554948 1e-129
CaES4885 Pepper.v.1.5.chr02 120836859 1e-114
CaES4886 Pepper.v.1.5.chr02 131767015 1e-133
CaES4893 Pepper.v.1.5.chr02 154057430 4e-29
CaES4900 Pepper.v.1.5.chr02 123601296 8e-89
CaES4902 Pepper.v.1.5.chr02 152276132 1e-145
CaES4908 Pepper.v.1.5.chr02 149655304 3e-87
CaES4918 Pepper.v.1.5.chr02 157742249 1e-116
CaES4920 Pepper.v.1.5.chr02 139455252 1e-120
CaES4939 Pepper.v.1.5.chr02 163143942 1e-100
CaES4941 Pepper.v.1.5.chr02 150959096 1e-129
CaES4942 Pepper.v.1.5.chr02 163778238 6e-89
CaES4944 Pepper.v.1.5.chr02 144847378 5e-92
CaES4947 Pepper.v.1.5.chr02 152724312 5e-57
CaES4951 Pepper.v.1.5.chr02 151295695 1e-105
CaES4978 Pepper.v.1.5.chr02 151185161 1e-107
CaES4982 Pepper.v.1.5.chr02 159536133 1e-117
CaES5024 0.0 180 Pepper.v.1.5.chr02 60620341 1e-150
CaES5033 Pepper.v.1.5.chr02 135566868 4e-34
CaES5038 Pepper.v.1.5.chr02 157681087 1e-29
CaES5042 Pepper.v.1.5.chr02 161914941 1e-141
CaES5055 Pepper.v.1.5.chr02 159106335 1e-114
CaES5061 Pepper.v.1.5.chr02 145252456 1e-108
CaES5066 Pepper.v.1.5.chr02 12124893 3e-45
CaES5071 Pepper.v.1.5.chr02 141539847 1e-133
CaES5081 Pepper.v.1.5.chr02 155707817 6e-80
CaES5091 Pepper.v.1.5.chr02 2558993 1e-83
CaES5106 Pepper.v.1.5.chr02 162642557 1e-139
CaES5115 Pepper.v.1.5.chr02 154387732 1e-104
CaES5119 Pepper.v.1.5.chr02 136909969 6e-85
CaES5138 Pepper.v.1.5.chr02 13411732 1e-153
CaES5139 Pepper.v.1.5.chr02 77056245 1e-135
CaES5161 Pepper.v.1.5.chr02 85620682 1e-98
CaES5176 Pepper.v.1.5.chr02 155421514 7e-73
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549

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