Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0010 Pepper.v.1.5.chr01 165937861 5e-90
CaES0027 Pepper.v.1.5.chr01 7002357 1e-133
CaES0047 Pepper.v.1.5.chr01 273713 1e-132
CaES0074 Pepper.v.1.5.chr01 161338879 1e-105
CaES0090 Pepper.v.1.5.chr01 216745596 1e-132
CaES0098 Pepper.v.1.5.chr01 126797534 3e-53
CaES0102 Pepper.v.1.5.chr01 6198396 9e-79
CaES0134 Pepper.v.1.5.chr01 219450813 1e-111
CaES0169 Pepper.v.1.5.chr01 163958323 2e-81
CaES0181 Pepper.v.1.5.chr01 727770 3e-78
CaES0187 Pepper.v.1.5.chr01 248790157 1e-95
CaES0233 Pepper.v.1.5.chr01 155193574 3e-33
CaES0256 Pepper.v.1.5.chr01 251717729 1e-120
CaES0258 Pepper.v.1.5.chr01 165559195 1e-39
CaES0290 Pepper.v.1.5.chr01 35559816 1e-125
CaES0293 Pepper.v.1.5.chr01 1319641 6e-98
CaES0295 Pepper.v.1.5.chr01 173770447 1e-59
CaES0297 Pepper.v.1.5.chr01 131089159 1e-148
CaES0316 Pepper.v.1.5.chr01 251449964 1e-120
CaES0332 Pepper.v.1.5.chr01 173770796 2e-28
CaES0361 Pepper.v.1.5.chr01 158620506 1e-108
CaES0372 Pepper.v.1.5.chr01 726854 2e-51
CaES0375 Pepper.v.1.5.chr01 6250931 1e-109
CaES0408 Pepper.v.1.5.chr01 73337442 1e-88
CaES0419 Pepper.v.1.5.chr01 37001150 2e-75
CaES0435 Pepper.v.1.5.chr01 126933560 6e-76
CaES0441 Pepper.v.1.5.chr01 52129018 1e-94
CaES0460 Pepper.v.1.5.chr01 1913001 2e-93
CaES0464 Pepper.v.1.5.chr01 219145781 1e-119
CaES0470 Pepper.v.1.5.chr01 251717684 3e-80
CaES0478 Pepper.v.1.5.chr01 157262328 9e-72
CaES0493 Pepper.v.1.5.chr01 182863038 2e-71
CaES0526 Pepper.v.1.5.chr01 158219082 1e-121
CaES0530 Pepper.v.1.5.chr01 4127158 1e-101
CaES0533 Pepper.v.1.5.chr01 210469423 6e-85
CaES0539 Pepper.v.1.5.chr01 252252163 1e-109
CaES0549 Pepper.v.1.5.chr01 215838844 1e-121
CaES0599 Pepper.v.1.5.chr01 30746155 1e-146
CaES0615 Pepper.v.1.5.chr01 11374092 1e-132
CaES0633 Pepper.v.1.5.chr01 84160208 1e-113
CaES0646 Pepper.v.1.5.chr01 97902174 1e-151
CaES0653 Pepper.v.1.5.chr01 6699193 1e-138
CaES0660 Pepper.v.1.5.chr01 15851009 1e-160
CaES0661 Pepper.v.1.5.chr01 251715821 4e-59
CaES0665 Pepper.v.1.5.chr01 3662002 1e-110
CaES0668 Pepper.v.1.5.chr01 19551238 6e-98
CaES0682 Pepper.v.1.5.chr01 175933416 1e-118
CaES0688 Pepper.v.1.5.chr01 119625969 1e-139
CaES0694 Pepper.v.1.5.chr01 12594738 1e-119
CaES0696 Pepper.v.1.5.chr01 27761153 3e-67
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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