Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4014 Pepper.v.1.5.chr01 16943331 1e-111
CaES4015 Pepper.v.1.5.chr01 37568247 1e-145
CaES4032 Pepper.v.1.5.chr01 27753810 7e-83
CaES4035 Pepper.v.1.5.chr01 156261364 1e-137
CaES4046 Pepper.v.1.5.chr01 105024915 3e-29
CaES4063 Pepper.v.1.5.chr01 19332894 1e-143
CaES4067 Pepper.v.1.5.chr01 245651374 5e-68
CaES4072 0.115 191 Pepper.v.1.5.chr01 76794631 1e-115
CaES4082 Pepper.v.1.5.chr01 1331495 1e-125
CaES4097 Pepper.v.1.5.chr01 727731 6e-31
CaES4098 Pepper.v.1.5.chr01 153570540 7e-88
CaES4110 Pepper.v.1.5.chr01 183015754 7e-22
CaES4119 Pepper.v.1.5.chr01 10793863 1e-56
CaES4124 Pepper.v.1.5.chr01 226433741 8e-69
CaES4152 Pepper.v.1.5.chr01 13344871 1e-108
CaES4167 Pepper.v.1.5.chr01 29869893 1e-118
CaES4187 Pepper.v.1.5.chr01 35890048 1e-77
CaES4202 Pepper.v.1.5.chr01 126799564 1e-55
CaES4204 Pepper.v.1.5.chr01 44314362 1e-104
CaES4205 Pepper.v.1.5.chr01 206624164 1e-123
CaES4208 Pepper.v.1.5.chr01 232997679 1e-151
CaES4210 Pepper.v.1.5.chr01 7684754 1e-113
CaES4223 Pepper.v.1.5.chr01 16518256 8e-54
CaES4234 Pepper.v.1.5.chr01 157650806 1e-134
CaES4238 Pepper.v.1.5.chr01 49235561 1e-126
CaES4252 Pepper.v.1.5.chr01 173408996 1e-131
CaES4265 Pepper.v.1.5.chr01 40335317 1e-147
CaES4270 Pepper.v.1.5.chr01 15849828 1e-160
CaES4273 Pepper.v.1.5.chr01 118506642 1e-161
CaES4274 Pepper.v.1.5.chr01 11495228 1e-113
CaES4276 Pepper.v.1.5.chr01 16390293 3e-53
CaES4277 Pepper.v.1.5.chr01 103373191 5e-87
CaES4302 Pepper.v.1.5.chr01 254892890 3e-45
CaES4333 Pepper.v.1.5.chr01 258185269 7e-88
CaES4342 Pepper.v.1.5.chr01 4984365 9e-97
CaES4356 Pepper.v.1.5.chr01 6825585 1e-135
CaES4376 0.396 149 Pepper.v.1.5.chr01 108109688 5e-26
CaES4381 Pepper.v.1.5.chr01 251577090 1e-103
CaES4383 Pepper.v.1.5.chr01 88439011 1e-135
CaES4388 Pepper.v.1.5.chr01 209624963 1e-49
CaES4389 Pepper.v.1.5.chr01 216540791 1e-136
CaES4392 Pepper.v.1.5.chr01 165260378 1e-127
CaES4396 Pepper.v.1.5.chr01 210468780 1e-91
CaES4398 Pepper.v.1.5.chr01 208506685 1e-137
CaES4402 Pepper.v.1.5.chr01 41177157 1e-153
CaES4404 Pepper.v.1.5.chr01 56921542 2e-72
CaES4405 Pepper.v.1.5.chr01 225974077 3e-84
CaES4414 Pepper.v.1.5.chr01 205657835 1e-116
CaES4416 Pepper.v.1.5.chr01 546949 1e-93
CaES4418 Pepper.v.1.5.chr01 197794866 1e-139
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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