Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4671 Pepper.v.1.5.chr01 153452772 1e-97
CaES4098 Pepper.v.1.5.chr01 153570540 7e-88
CaES3868 Pepper.v.1.5.chr01 154334553 7e-29
CaES3903 Pepper.v.1.5.chr01 154371250 2e-60
CaES1736 Pepper.v.1.5.chr01 154424153 1e-113
CaES3898 Pepper.v.1.5.chr01 154440109 2e-75
CaES5299 Pepper.v.1.5.chr01 155032323 2e-83
CaES5474 Pepper.v.1.5.chr01 155067271 5e-78
CaES4684 Pepper.v.1.5.chr01 155096984 5e-73
CaES2979 Pepper.v.1.5.chr01 155169367 1e-111
CaES0233 Pepper.v.1.5.chr01 155193574 3e-33
CaES2658 Pepper.v.1.5.chr01 155533483 1e-100
CaES3419 Pepper.v.1.5.chr01 155898878 1e-127
CaES1677 Pepper.v.1.5.chr01 156077309 1e-135
CaES4035 Pepper.v.1.5.chr01 156261364 1e-137
CaES5393 Pepper.v.1.5.chr01 156527784 1e-116
CaES1644 Pepper.v.1.5.chr01 156694846 1e-104
CaES5637 Pepper.v.1.5.chr01 156696099 6e-87
CaES2551 Pepper.v.1.5.chr01 156728884 1e-118
CaES1791 Pepper.v.1.5.chr01 157044866 1e-28
CaES5291 Pepper.v.1.5.chr01 157067916 1e-78
CaES0478 Pepper.v.1.5.chr01 157262328 9e-72
CaES2283 Pepper.v.1.5.chr01 157451917 1e-130
CaES5525 Pepper.v.1.5.chr01 157498579 3e-63
CaES4234 Pepper.v.1.5.chr01 157650806 1e-134
CaES3778 Pepper.v.1.5.chr01 157670854 1e-164
CaES4970 Pepper.v.1.5.chr01 157702119 1e-138
CaES5472 Pepper.v.1.5.chr01 157707381 2e-92
CaES4493 Pepper.v.1.5.chr01 158064760 1e-106
CaES0526 Pepper.v.1.5.chr01 158219082 1e-121
CaES0361 Pepper.v.1.5.chr01 158620506 1e-108
CaES5281 Pepper.v.1.5.chr01 158778115 9e-58
CaES5631 Pepper.v.1.5.chr01 158826341 3e-38
CaES1412 Pepper.v.1.5.chr01 158879814 3e-95
CaES5288 Pepper.v.1.5.chr01 158979319 9e-80
CaES5683 Pepper.v.1.5.chr01 159404623 1e-163
CaES1673 Pepper.v.1.5.chr01 160363067 1e-42
CaES0074 Pepper.v.1.5.chr01 161338879 1e-105
CaES3427 Pepper.v.1.5.chr01 161566135 1e-148
CaES0819 Pepper.v.1.5.chr01 162413734 1e-111
CaES5725 Pepper.v.1.5.chr01 162810835 1e-123
CaES1241 Pepper.v.1.5.chr01 162827236 5e-92
CaES2770 Pepper.v.1.5.chr01 162828607 1e-127
CaES3556 Pepper.v.1.5.chr01 162840797 1e-114
CaES2812 Pepper.v.1.5.chr01 163064713 1e-128
CaES5164 Pepper.v.1.5.chr01 163231693 3e-86
CaES5635 Pepper.v.1.5.chr01 163287167 4e-25
CaES5205 Pepper.v.1.5.chr01 163800410 2e-36
CaES1278 Pepper.v.1.5.chr01 163800416 5e-34
CaES0169 Pepper.v.1.5.chr01 163958323 2e-81
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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