Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3023 Pepper.v.1.5.chr01 144973914 1e-103
CaES3042 Pepper.v.1.5.chr01 1917482 1e-144
CaES3056 Pepper.v.1.5.chr01 40321267 1e-124
CaES3061 Pepper.v.1.5.chr01 5023375 3e-57
CaES3062 Pepper.v.1.5.chr01 12255153 1e-35
CaES3077 Pepper.v.1.5.chr01 150395283 2e-61
CaES3105 Pepper.v.1.5.chr01 144971692 2e-85
CaES3106 Pepper.v.1.5.chr01 251306014 4e-30
CaES3109 Pepper.v.1.5.chr01 214298581 1e-138
CaES3111 Pepper.v.1.5.chr01 30747187 1e-123
CaES3136 Pepper.v.1.5.chr01 139344446 1e-116
CaES3137 Pepper.v.1.5.chr01 252710387 1e-106
CaES3145 Pepper.v.1.5.chr01 43866168 2e-92
CaES3152 Pepper.v.1.5.chr01 216410310 1e-133
CaES3163 Pepper.v.1.5.chr01 70531855 1e-142
CaES3164 Pepper.v.1.5.chr01 257739314 1e-142
CaES3165 Pepper.v.1.5.chr01 29626196 1e-126
CaES3203 Pepper.v.1.5.chr01 2652006 6e-70
CaES3206 Pepper.v.1.5.chr01 252995165 5e-63
CaES3231 Pepper.v.1.5.chr01 30105031 3e-87
CaES3241 Pepper.v.1.5.chr01 65742577 3e-62
CaES3242 Pepper.v.1.5.chr01 172205205 1e-59
CaES3251 Pepper.v.1.5.chr01 248476908 1e-119
CaES3260 Pepper.v.1.5.chr01 182098114 7e-96
CaES3261 Pepper.v.1.5.chr01 214524016 9e-64
CaES3266 Pepper.v.1.5.chr01 211302199 1e-128
CaES3275 Pepper.v.1.5.chr01 1739554 7e-49
CaES3276 Pepper.v.1.5.chr01 136678109 1e-113
CaES3277 Pepper.v.1.5.chr01 24602467 1e-112
CaES3284 Pepper.v.1.5.chr01 252995165 8e-42
CaES3293 Pepper.v.1.5.chr01 21824813 1e-47
CaES3313 Pepper.v.1.5.chr01 165400284 4e-64
CaES3316 Pepper.v.1.5.chr01 44430027 3e-58
CaES3317 Pepper.v.1.5.chr01 251119158 1e-113
CaES3330 Pepper.v.1.5.chr01 76828365 1e-61
CaES3333 Pepper.v.1.5.chr01 27478165 3e-94
CaES3334 Pepper.v.1.5.chr01 45007739 6e-80
CaES3335 Pepper.v.1.5.chr01 37611785 2e-44
CaES3339 Pepper.v.1.5.chr01 248874535 4e-28
CaES3342 Pepper.v.1.5.chr01 148074583 8e-57
CaES3363 Pepper.v.1.5.chr01 105024915 7e-81
CaES3364 Pepper.v.1.5.chr01 57643460 5e-26
CaES3365 Pepper.v.1.5.chr01 19877421 3e-59
CaES3368 Pepper.v.1.5.chr01 235771611 1e-115
CaES3400 Pepper.v.1.5.chr01 174644424 1e-99
CaES3408 Pepper.v.1.5.chr01 246800173 1e-124
CaES3418 Pepper.v.1.5.chr01 38952286 1e-136
CaES3419 Pepper.v.1.5.chr01 155898878 1e-127
CaES3427 Pepper.v.1.5.chr01 161566135 1e-148
CaES3431 Pepper.v.1.5.chr01 4224456 1e-118
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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