Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2416 Pepper.v.1.5.chr01 218984452 4e-42
CaES2420 Pepper.v.1.5.chr01 252284269 3e-65
CaES2422 Pepper.v.1.5.chr01 251718259 1e-116
CaES2423 Pepper.v.1.5.chr01 216504973 2e-71
CaES2429 Pepper.v.1.5.chr01 251733910 3e-80
CaES2454 Pepper.v.1.5.chr01 117891630 7e-61
CaES2455 Pepper.v.1.5.chr01 190049243 3e-57
CaES2458 Pepper.v.1.5.chr01 35529312 2e-62
CaES2482 Pepper.v.1.5.chr01 16968289 1e-92
CaES2485 Pepper.v.1.5.chr01 233433809 2e-64
CaES2511 Pepper.v.1.5.chr01 11278938 2e-79
CaES2535 Pepper.v.1.5.chr01 213273702 1e-115
CaES2536 Pepper.v.1.5.chr01 44846910 1e-111
CaES2537 Pepper.v.1.5.chr01 11373567 4e-56
CaES2540 Pepper.v.1.5.chr01 26617045 1e-107
CaES2551 Pepper.v.1.5.chr01 156728884 1e-118
CaES2552 Pepper.v.1.5.chr01 224095399 4e-94
CaES2557 Pepper.v.1.5.chr01 12113805 1e-109
CaES2620 Pepper.v.1.5.chr01 76107277 2e-23
CaES2625 Pepper.v.1.5.chr01 2438994 3e-86
CaES2631 Pepper.v.1.5.chr01 10075472 2e-68
CaES2637 Pepper.v.1.5.chr01 153373060 1e-142
CaES2653 Pepper.v.1.5.chr01 9238191 7e-53
CaES2658 Pepper.v.1.5.chr01 155533483 1e-100
CaES2659 Pepper.v.1.5.chr01 23815116 3e-46
CaES2665 Pepper.v.1.5.chr01 14556376 3e-84
CaES2675 Pepper.v.1.5.chr01 213169986 1e-116
CaES2706 Pepper.v.1.5.chr01 134797779 8e-45
CaES2708 Pepper.v.1.5.chr01 56969976 1e-143
CaES2714 Pepper.v.1.5.chr01 71851248 1e-137
CaES2736 Pepper.v.1.5.chr01 56970218 1e-128
CaES2743 Pepper.v.1.5.chr01 129560478 1e-114
CaES2745 Pepper.v.1.5.chr01 172649418 1e-147
CaES2749 Pepper.v.1.5.chr01 57692335 1e-143
CaES2769 Pepper.v.1.5.chr01 4444898 1e-144
CaES2770 Pepper.v.1.5.chr01 162828607 1e-127
CaES2780 Pepper.v.1.5.chr01 71865850 1e-106
CaES2798 Pepper.v.1.5.chr01 222610285 1e-141
CaES2808 Pepper.v.1.5.chr01 2848114 8e-81
CaES2812 Pepper.v.1.5.chr01 163064713 1e-128
CaES2848 Pepper.v.1.5.chr01 136814232 1e-145
CaES2878 Pepper.v.1.5.chr01 67424245 1e-100
CaES2887 Pepper.v.1.5.chr01 244440095 4e-87
CaES2943 Pepper.v.1.5.chr01 61274663 1e-126
CaES2959 Pepper.v.1.5.chr01 23777589 5e-82
CaES2979 Pepper.v.1.5.chr01 155169367 1e-111
CaES2980 Pepper.v.1.5.chr01 164823667 1e-113
CaES3012 Pepper.v.1.5.chr01 200340192 1e-126
CaES3016 Pepper.v.1.5.chr01 102192119 1e-116
CaES3018 Pepper.v.1.5.chr01 218542024 3e-93
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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