Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1831 Pepper.v.1.5.chr01 89759240 4e-76
CaES1837 Pepper.v.1.5.chr01 261148581 8e-77
CaES1864 Pepper.v.1.5.chr01 17433388 1e-122
CaES1868 Pepper.v.1.5.chr01 1373882 2e-45
CaES1872 Pepper.v.1.5.chr01 27970435 9e-30
CaES1922 Pepper.v.1.5.chr01 55824159 1e-102
CaES1925 Pepper.v.1.5.chr01 182512651 1e-88
CaES1940 Pepper.v.1.5.chr01 41181802 1e-132
CaES1951 Pepper.v.1.5.chr01 214309339 5e-54
CaES1952 Pepper.v.1.5.chr01 79705098 3e-90
CaES1971 Pepper.v.1.5.chr01 40240790 6e-37
CaES1975 Pepper.v.1.5.chr01 232704048 3e-60
CaES1976 Pepper.v.1.5.chr01 121848101 1e-105
CaES1978 Pepper.v.1.5.chr01 188776784 1e-108
CaES1980 Pepper.v.1.5.chr01 170248763 1e-122
CaES1990 Pepper.v.1.5.chr01 246744251 1e-119
CaES2008 Pepper.v.1.5.chr01 38772507 1e-132
CaES2014 Pepper.v.1.5.chr01 14787923 1e-122
CaES2049 Pepper.v.1.5.chr01 134187946 1e-110
CaES2058 Pepper.v.1.5.chr01 4248153 2e-96
CaES2075 Pepper.v.1.5.chr01 34302528 1e-115
CaES2079 Pepper.v.1.5.chr01 27736373 1e-96
CaES2087 Pepper.v.1.5.chr01 196472054 1e-122
CaES2096 Pepper.v.1.5.chr01 123490221 1e-108
CaES2100 Pepper.v.1.5.chr01 153208390 1e-94
CaES2104 Pepper.v.1.5.chr01 37629936 3e-90
CaES2105 Pepper.v.1.5.chr01 17581046 4e-67
CaES2106 Pepper.v.1.5.chr01 249700918 1e-130
CaES2122 Pepper.v.1.5.chr01 188362197 1e-116
CaES2148 Pepper.v.1.5.chr01 66910325 1e-55
CaES2149 Pepper.v.1.5.chr01 165303915 1e-114
CaES2162 Pepper.v.1.5.chr01 213119421 1e-122
CaES2174 Pepper.v.1.5.chr01 153329695 3e-89
CaES2181 Pepper.v.1.5.chr01 14781998 1e-75
CaES2212 Pepper.v.1.5.chr01 188198934 1e-124
CaES2214 Pepper.v.1.5.chr01 151900806 1e-122
CaES2230 Pepper.v.1.5.chr01 2250904 3e-79
CaES2240 Pepper.v.1.5.chr01 126798978 4e-48
CaES2241 Pepper.v.1.5.chr01 15624324 2e-43
CaES2250 Pepper.v.1.5.chr01 200244115 1e-130
CaES2255 Pepper.v.1.5.chr01 177945900 1e-103
CaES2261 Pepper.v.1.5.chr01 13508861 1e-123
CaES2271 Pepper.v.1.5.chr01 179202400 1e-142
CaES2283 Pepper.v.1.5.chr01 157451917 1e-130
CaES2284 Pepper.v.1.5.chr01 34133566 9e-26
CaES2287 Pepper.v.1.5.chr01 153381929 8e-67
CaES2325 Pepper.v.1.5.chr01 9859638 1e-119
CaES2391 Pepper.v.1.5.chr01 1505593 3e-95
CaES2407 Pepper.v.1.5.chr01 27782216 1e-118
CaES2410 Pepper.v.1.5.chr01 251734726 2e-38
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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