Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1241 Pepper.v.1.5.chr01 162827236 5e-92
CaES1265 Pepper.v.1.5.chr01 1927557 1e-141
CaES1277 Pepper.v.1.5.chr01 188894505 1e-107
CaES1278 Pepper.v.1.5.chr01 163800416 5e-34
CaES1301 Pepper.v.1.5.chr01 193321626 1e-125
CaES1319 Pepper.v.1.5.chr01 67274169 1e-138
CaES1325 Pepper.v.1.5.chr01 1295053 3e-49
CaES1346 Pepper.v.1.5.chr01 44984281 1e-74
CaES1348 Pepper.v.1.5.chr01 118506978 1e-119
CaES1349 Pepper.v.1.5.chr01 226747663 5e-79
CaES1361 Pepper.v.1.5.chr01 35948107 2e-75
CaES1363 Pepper.v.1.5.chr01 16227267 1e-91
CaES1397 Pepper.v.1.5.chr01 224119829 4e-89
CaES1407 Pepper.v.1.5.chr01 62482601 5e-63
CaES1410 Pepper.v.1.5.chr01 3621358 4e-46
CaES1412 Pepper.v.1.5.chr01 158879814 3e-95
CaES1435 Pepper.v.1.5.chr01 125646596 1e-109
CaES1440 Pepper.v.1.5.chr01 37525997 4e-44
CaES1443 Pepper.v.1.5.chr01 6945423 4e-65
CaES1445 Pepper.v.1.5.chr01 4441619 1e-109
CaES1481 Pepper.v.1.5.chr01 13498158 1e-70
CaES1483 Pepper.v.1.5.chr01 116916162 7e-96
CaES1499 Pepper.v.1.5.chr01 230819952 4e-90
CaES1509 Pepper.v.1.5.chr01 5688377 8e-74
CaES1527 Pepper.v.1.5.chr01 212938629 1e-127
CaES1562 Pepper.v.1.5.chr01 195952076 9e-48
CaES1590 Pepper.v.1.5.chr01 12113436 6e-88
CaES1602 Pepper.v.1.5.chr01 7721689 1e-143
CaES1604 Pepper.v.1.5.chr01 11741926 1e-107
CaES1611 Pepper.v.1.5.chr01 169354381 1e-125
CaES1614 Pepper.v.1.5.chr01 15741252 1e-138
CaES1630 Pepper.v.1.5.chr01 49123283 3e-84
CaES1644 Pepper.v.1.5.chr01 156694846 1e-104
CaES1673 Pepper.v.1.5.chr01 160363067 1e-42
CaES1677 Pepper.v.1.5.chr01 156077309 1e-135
CaES1683 Pepper.v.1.5.chr01 67276816 4e-33
CaES1696 Pepper.v.1.5.chr01 89783170 1e-120
CaES1706 Pepper.v.1.5.chr01 203300145 1e-125
CaES1717 Pepper.v.1.5.chr01 39812874 1e-115
CaES1720 Pepper.v.1.5.chr01 7520873 4e-69
CaES1736 Pepper.v.1.5.chr01 154424153 1e-113
CaES1751 Pepper.v.1.5.chr01 190782088 1e-53
CaES1768 Pepper.v.1.5.chr01 208640340 1e-113
CaES1772 Pepper.v.1.5.chr01 251715777 1e-33
CaES1774 Pepper.v.1.5.chr01 11373420 7e-29
CaES1783 Pepper.v.1.5.chr01 26617169 6e-27
CaES1791 Pepper.v.1.5.chr01 157044866 1e-28
CaES1792 Pepper.v.1.5.chr01 243955319 2e-29
CaES1827 Pepper.v.1.5.chr01 140872241 9e-97
CaES1830 Pepper.v.1.5.chr01 261406733 1e-156
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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