Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES5486 Pepper.v.1.5.chr01 3885602 1e-59
CaES1177 Pepper.v.1.5.chr01 4099054 1e-152
CaES3743 Pepper.v.1.5.chr01 4123783 2e-93
CaES0530 Pepper.v.1.5.chr01 4127158 1e-101
CaES3861 Pepper.v.1.5.chr01 4159073 1e-126
CaES3795 Pepper.v.1.5.chr01 4223889 1e-115
CaES3431 Pepper.v.1.5.chr01 4224456 1e-118
CaES2058 Pepper.v.1.5.chr01 4248153 2e-96
CaES1445 Pepper.v.1.5.chr01 4441619 1e-109
CaES2769 Pepper.v.1.5.chr01 4444898 1e-144
CaES5074 Pepper.v.1.5.chr01 4983614 1e-106
CaES4342 Pepper.v.1.5.chr01 4984365 9e-97
CaES3061 Pepper.v.1.5.chr01 5023375 3e-57
CaES1509 Pepper.v.1.5.chr01 5688377 8e-74
CaES4011 Pepper.v.1.5.chr01 6161446 1e-119
CaES3799 Pepper.v.1.5.chr01 6198396 3e-46
CaES0102 Pepper.v.1.5.chr01 6198396 9e-79
CaES0375 Pepper.v.1.5.chr01 6250931 1e-109
CaES0653 Pepper.v.1.5.chr01 6699193 1e-138
CaES4736 Pepper.v.1.5.chr01 6817951 2e-97
CaES4356 Pepper.v.1.5.chr01 6825585 1e-135
CaES1443 Pepper.v.1.5.chr01 6945423 4e-65
CaES0027 Pepper.v.1.5.chr01 7002357 1e-133
CaES1720 Pepper.v.1.5.chr01 7520873 4e-69
CaES4210 Pepper.v.1.5.chr01 7684754 1e-113
CaES1602 Pepper.v.1.5.chr01 7721689 1e-143
CaES5388 Pepper.v.1.5.chr01 7783376 4e-39
CaES1153 Pepper.v.1.5.chr01 8270670 8e-59
CaES0790 Pepper.v.1.5.chr01 9000672 1e-59
CaES1115 Pepper.v.1.5.chr01 9103244 7e-56
CaES2653 Pepper.v.1.5.chr01 9238191 7e-53
CaES5047 Pepper.v.1.5.chr01 9646707 8e-98
CaES2325 Pepper.v.1.5.chr01 9859638 1e-119
CaES5557 Pepper.v.1.5.chr01 9937984 2e-80
CaES2631 Pepper.v.1.5.chr01 10075472 2e-68
CaES3966 Pepper.v.1.5.chr01 10507942 1e-105
CaES4119 Pepper.v.1.5.chr01 10793863 1e-56
CaES2511 Pepper.v.1.5.chr01 11278938 2e-79
CaES4803 Pepper.v.1.5.chr01 11279184 1e-129
CaES1774 Pepper.v.1.5.chr01 11373420 7e-29
CaES1123 Pepper.v.1.5.chr01 11373420 6e-81
CaES2537 Pepper.v.1.5.chr01 11373567 4e-56
CaES0615 Pepper.v.1.5.chr01 11374092 1e-132
CaES4274 Pepper.v.1.5.chr01 11495228 1e-113
CaES1604 Pepper.v.1.5.chr01 11741926 1e-107
CaES1590 Pepper.v.1.5.chr01 12113436 6e-88
CaES2557 Pepper.v.1.5.chr01 12113805 1e-109
CaES3062 Pepper.v.1.5.chr01 12255153 1e-35
CaES4437 Pepper.v.1.5.chr01 12593955 4e-55
CaES0694 Pepper.v.1.5.chr01 12594738 1e-119
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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