Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0705 Pepper.v.1.5.chr01 196877711 4e-98
CaES0717 Pepper.v.1.5.chr01 248526133 4e-82
CaES0718 Pepper.v.1.5.chr01 261450539 6e-93
CaES0719 Pepper.v.1.5.chr01 326540 3e-25
CaES0728 Pepper.v.1.5.chr01 251743221 4e-53
CaES0731 Pepper.v.1.5.chr01 125647141 1e-121
CaES0732 Pepper.v.1.5.chr01 274657 1e-146
CaES0735 Pepper.v.1.5.chr01 217101388 1e-128
CaES0742 Pepper.v.1.5.chr01 219187166 1e-114
CaES0772 Pepper.v.1.5.chr01 226747238 1e-125
CaES0774 Pepper.v.1.5.chr01 37630304 4e-78
CaES0782 Pepper.v.1.5.chr01 15417507 2e-83
CaES0790 Pepper.v.1.5.chr01 9000672 1e-59
CaES0812 Pepper.v.1.5.chr01 1071157 1e-119
CaES0814 Pepper.v.1.5.chr01 219345981 1e-59
CaES0819 Pepper.v.1.5.chr01 162413734 1e-111
CaES0823 Pepper.v.1.5.chr01 62427564 2e-91
CaES0857 Pepper.v.1.5.chr01 218936532 1e-121
CaES0886 Pepper.v.1.5.chr01 97901930 5e-86
CaES0895 Pepper.v.1.5.chr01 243834487 1e-102
CaES0902 Pepper.v.1.5.chr01 38783211 1e-127
CaES0921 Pepper.v.1.5.chr01 88072520 3e-55
CaES0943 Pepper.v.1.5.chr01 753054 9e-35
CaES0946 Pepper.v.1.5.chr01 248581860 1e-114
CaES0969 Pepper.v.1.5.chr01 23495620 1e-133
CaES0991 Pepper.v.1.5.chr01 237766443 1e-102
CaES0997 Pepper.v.1.5.chr01 50155999 6e-71
CaES1003 0.095 192 Pepper.v.1.5.chr01 165736225 1e-121
CaES1021 Pepper.v.1.5.chr01 182245965 9e-85
CaES1053 Pepper.v.1.5.chr01 220469002 2e-96
CaES1061 Pepper.v.1.5.chr01 68304548 1e-137
CaES1084 Pepper.v.1.5.chr01 98325976 5e-95
CaES1104 Pepper.v.1.5.chr01 2308811 1e-149
CaES1111 Pepper.v.1.5.chr01 244536336 1e-125
CaES1113 Pepper.v.1.5.chr01 182549633 1e-117
CaES1114 Pepper.v.1.5.chr01 206618538 1e-129
CaES1115 Pepper.v.1.5.chr01 9103244 7e-56
CaES1120 Pepper.v.1.5.chr01 55768953 1e-79
CaES1123 Pepper.v.1.5.chr01 11373420 6e-81
CaES1141 Pepper.v.1.5.chr01 88436695 4e-88
CaES1143 Pepper.v.1.5.chr01 212983184 1e-115
CaES1153 Pepper.v.1.5.chr01 8270670 8e-59
CaES1157 Pepper.v.1.5.chr01 2169800 1e-116
CaES1174 Pepper.v.1.5.chr01 12862732 1e-105
CaES1177 Pepper.v.1.5.chr01 4099054 1e-152
CaES1197 Pepper.v.1.5.chr01 41571308 6e-62
CaES1204 Pepper.v.1.5.chr01 3800845 1e-111
CaES1207 Pepper.v.1.5.chr01 43963689 1e-122
CaES1214 Pepper.v.1.5.chr01 224074342 5e-87
CaES1225 Pepper.v.1.5.chr01 245292006 1e-103
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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