Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0717 Pepper.v.1.5.chr01 248526133 4e-82
CaES4743 Pepper.v.1.5.chr01 248530639 1e-125
CaES0946 Pepper.v.1.5.chr01 248581860 1e-114
CaES5008 Pepper.v.1.5.chr01 248677807 1e-80
CaES3711 Pepper.v.1.5.chr01 248679607 1e-85
CaES0187 Pepper.v.1.5.chr01 248790157 1e-95
CaES3339 Pepper.v.1.5.chr01 248874535 4e-28
CaES4661 Pepper.v.1.5.chr01 249076960 1e-111
CaES4498 Pepper.v.1.5.chr01 249152908 2e-91
CaES2106 Pepper.v.1.5.chr01 249700918 1e-130
CaES5086 Pepper.v.1.5.chr01 250336079 1e-142
CaES3317 Pepper.v.1.5.chr01 251119158 1e-113
CaES3106 Pepper.v.1.5.chr01 251306014 4e-30
CaES0316 Pepper.v.1.5.chr01 251449964 1e-120
CaES4381 Pepper.v.1.5.chr01 251577090 1e-103
CaES1772 Pepper.v.1.5.chr01 251715777 1e-33
CaES0661 Pepper.v.1.5.chr01 251715821 4e-59
CaES3562 Pepper.v.1.5.chr01 251716147 1e-104
CaES0470 Pepper.v.1.5.chr01 251717684 3e-80
CaES0256 Pepper.v.1.5.chr01 251717729 1e-120
CaES2422 Pepper.v.1.5.chr01 251718259 1e-116
CaES5117 Pepper.v.1.5.chr01 251718282 1e-131
CaES2429 Pepper.v.1.5.chr01 251733910 3e-80
CaES2410 Pepper.v.1.5.chr01 251734726 2e-38
CaES0728 Pepper.v.1.5.chr01 251743221 4e-53
CaES3452 Pepper.v.1.5.chr01 251871464 1e-147
CaES5166 Pepper.v.1.5.chr01 252201665 1e-100
CaES0539 Pepper.v.1.5.chr01 252252163 1e-109
CaES2420 Pepper.v.1.5.chr01 252284269 3e-65
CaES3137 Pepper.v.1.5.chr01 252710387 1e-106
CaES3206 Pepper.v.1.5.chr01 252995165 5e-63
CaES3284 Pepper.v.1.5.chr01 252995165 8e-42
CaES5434 Pepper.v.1.5.chr01 253294561 9e-31
CaES4302 Pepper.v.1.5.chr01 254892890 3e-45
CaES3476 Pepper.v.1.5.chr01 255536973 4e-82
CaES3164 Pepper.v.1.5.chr01 257739314 1e-142
CaES4333 Pepper.v.1.5.chr01 258185269 7e-88
CaES4652 Pepper.v.1.5.chr01 259092534 2e-29
CaES4713 Pepper.v.1.5.chr01 260570306 2e-77
CaES5349 Pepper.v.1.5.chr01 261124862 4e-34
CaES1837 Pepper.v.1.5.chr01 261148581 8e-77
CaES1830 Pepper.v.1.5.chr01 261406733 1e-156
CaES3887 Pepper.v.1.5.chr01 261422043 1e-141
CaES0718 Pepper.v.1.5.chr01 261450539 6e-93
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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