Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES5388 Pepper.v.1.5.chr01 7783376 4e-39
CaES5393 Pepper.v.1.5.chr01 156527784 1e-116
CaES5404 Pepper.v.1.5.chr01 168938031 3e-32
CaES5416 Pepper.v.1.5.chr01 175943450 2e-78
CaES5434 Pepper.v.1.5.chr01 253294561 9e-31
CaES5443 Pepper.v.1.5.chr01 208640972 2e-54
CaES5459 Pepper.v.1.5.chr01 76691472 9e-46
CaES5466 Pepper.v.1.5.chr01 23000438 2e-61
CaES5472 Pepper.v.1.5.chr01 157707381 2e-92
CaES5474 Pepper.v.1.5.chr01 155067271 5e-78
CaES5485 Pepper.v.1.5.chr01 37553721 1e-57
CaES5486 Pepper.v.1.5.chr01 3885602 1e-59
CaES5487 Pepper.v.1.5.chr01 218892381 3e-76
CaES5494 Pepper.v.1.5.chr01 12594738 9e-71
CaES5508 Pepper.v.1.5.chr01 150880 2e-94
CaES5509 Pepper.v.1.5.chr01 3292240 2e-61
CaES5516 Pepper.v.1.5.chr01 217505939 3e-53
CaES5517 Pepper.v.1.5.chr01 14744970 3e-46
CaES5525 Pepper.v.1.5.chr01 157498579 3e-63
CaES5536 Pepper.v.1.5.chr01 188884822 9e-66
CaES5548 Pepper.v.1.5.chr01 44403223 1e-105
CaES5551 Pepper.v.1.5.chr01 75041625 6e-77
CaES5557 Pepper.v.1.5.chr01 9937984 2e-80
CaES5569 Pepper.v.1.5.chr01 209624641 1e-36
CaES5571 Pepper.v.1.5.chr01 68298466 3e-24
CaES5576 Pepper.v.1.5.chr01 218965574 1e-101
CaES5588 Pepper.v.1.5.chr01 17639983 3e-77
CaES5591 Pepper.v.1.5.chr01 62427544 1e-41
CaES5594 Pepper.v.1.5.chr01 246873 1e-85
CaES5603 Pepper.v.1.5.chr01 246227582 3e-61
CaES5614 Pepper.v.1.5.chr01 129074590 1e-113
CaES5623 Pepper.v.1.5.chr01 41570925 4e-87
CaES5631 Pepper.v.1.5.chr01 158826341 3e-38
CaES5635 Pepper.v.1.5.chr01 163287167 4e-25
CaES5637 Pepper.v.1.5.chr01 156696099 6e-87
CaES5645 Pepper.v.1.5.chr01 96897106 2e-96
CaES5677 Pepper.v.1.5.chr01 61071506 1e-145
CaES5683 Pepper.v.1.5.chr01 159404623 1e-163
CaES5719 Pepper.v.1.5.chr01 75042558 1e-115
CaES5725 Pepper.v.1.5.chr01 162810835 1e-123
CaES5729 Pepper.v.1.5.chr01 167198466 1e-127
CaES5743 Pepper.v.1.5.chr01 35965924 3e-42
CaES5750 Pepper.v.1.5.chr01 196165103 9e-54
CaES5751 Pepper.v.1.5.chr01 147663939 7e-65
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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