Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4917 Pepper.v.1.5.chr01 1272595 1e-104
CaES4923 Pepper.v.1.5.chr01 246122090 4e-26
CaES4960 Pepper.v.1.5.chr01 77253956 1e-167
CaES4970 Pepper.v.1.5.chr01 157702119 1e-138
CaES4981 Pepper.v.1.5.chr01 198213315 1e-130
CaES4996 Pepper.v.1.5.chr01 173807447 1e-134
CaES5002 Pepper.v.1.5.chr01 44977678 1e-103
CaES5008 Pepper.v.1.5.chr01 248677807 1e-80
CaES5016 Pepper.v.1.5.chr01 85573341 5e-90
CaES5040 Pepper.v.1.5.chr01 244440660 3e-34
CaES5047 Pepper.v.1.5.chr01 9646707 8e-98
CaES5056 Pepper.v.1.5.chr01 167152659 1e-143
CaES5058 Pepper.v.1.5.chr01 218965382 1e-128
CaES5060 Pepper.v.1.5.chr01 3093282 3e-27
CaES5069 Pepper.v.1.5.chr01 14744973 1e-114
CaES5070 Pepper.v.1.5.chr01 92940985 3e-32
CaES5074 Pepper.v.1.5.chr01 4983614 1e-106
CaES5075 Pepper.v.1.5.chr01 1505460 1e-131
CaES5086 Pepper.v.1.5.chr01 250336079 1e-142
CaES5088 Pepper.v.1.5.chr01 64297207 2e-99
CaES5100 Pepper.v.1.5.chr01 13508132 1e-79
CaES5117 Pepper.v.1.5.chr01 251718282 1e-131
CaES5137 Pepper.v.1.5.chr01 153371333 1e-106
CaES5151 Pepper.v.1.5.chr01 20192866 5e-70
CaES5160 Pepper.v.1.5.chr01 58786165 1e-22
CaES5164 Pepper.v.1.5.chr01 163231693 3e-86
CaES5166 Pepper.v.1.5.chr01 252201665 1e-100
CaES5167 Pepper.v.1.5.chr01 190049243 6e-60
CaES5180 Pepper.v.1.5.chr01 117507432 1e-128
CaES5190 Pepper.v.1.5.chr01 79209977 1e-124
CaES5202 Pepper.v.1.5.chr01 140848941 2e-30
CaES5205 Pepper.v.1.5.chr01 163800410 2e-36
CaES5212 Pepper.v.1.5.chr01 21824909 4e-45
CaES5235 Pepper.v.1.5.chr01 164339539 2e-41
CaES5248 Pepper.v.1.5.chr01 224800723 2e-98
CaES5278 Pepper.v.1.5.chr01 70955044 1e-104
CaES5281 Pepper.v.1.5.chr01 158778115 9e-58
CaES5288 Pepper.v.1.5.chr01 158979319 9e-80
CaES5291 Pepper.v.1.5.chr01 157067916 1e-78
CaES5292 Pepper.v.1.5.chr01 98327864 1e-130
CaES5299 Pepper.v.1.5.chr01 155032323 2e-83
CaES5301 0.432 188 Pepper.v.1.5.chr01 38037199 1e-36
CaES5307 Pepper.v.1.5.chr01 173450908 3e-30
CaES5317 Pepper.v.1.5.chr01 92450116 6e-57
CaES5318 Pepper.v.1.5.chr01 180691942 3e-65
CaES5331 Pepper.v.1.5.chr01 206659896 1e-103
CaES5339 Pepper.v.1.5.chr01 185246774 8e-66
CaES5349 Pepper.v.1.5.chr01 261124862 4e-34
CaES5357 Pepper.v.1.5.chr01 123217772 6e-45
CaES5372 Pepper.v.1.5.chr01 196165108 8e-56
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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