Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3980 Pepper.v.1.5.chr01 218897200 1e-127
CaES0857 Pepper.v.1.5.chr01 218936532 1e-121
CaES5058 Pepper.v.1.5.chr01 218965382 1e-128
CaES5576 Pepper.v.1.5.chr01 218965574 1e-101
CaES2416 Pepper.v.1.5.chr01 218984452 4e-42
CaES0464 Pepper.v.1.5.chr01 219145781 1e-119
CaES0742 Pepper.v.1.5.chr01 219187166 1e-114
CaES0814 Pepper.v.1.5.chr01 219345981 1e-59
CaES0134 Pepper.v.1.5.chr01 219450813 1e-111
CaES4914 Pepper.v.1.5.chr01 219451756 1e-138
CaES3855 Pepper.v.1.5.chr01 219679655 1e-118
CaES1053 Pepper.v.1.5.chr01 220469002 2e-96
CaES2798 Pepper.v.1.5.chr01 222610285 1e-141
CaES4502 Pepper.v.1.5.chr01 222819995 1e-64
CaES1214 Pepper.v.1.5.chr01 224074342 5e-87
CaES2552 Pepper.v.1.5.chr01 224095399 4e-94
CaES1397 Pepper.v.1.5.chr01 224119829 4e-89
CaES5248 Pepper.v.1.5.chr01 224800723 2e-98
CaES4405 Pepper.v.1.5.chr01 225974077 3e-84
CaES4124 Pepper.v.1.5.chr01 226433741 8e-69
CaES0772 Pepper.v.1.5.chr01 226747238 1e-125
CaES1349 Pepper.v.1.5.chr01 226747663 5e-79
CaES4480 Pepper.v.1.5.chr01 227070556 6e-58
CaES1499 Pepper.v.1.5.chr01 230819952 4e-90
CaES1975 Pepper.v.1.5.chr01 232704048 3e-60
CaES4208 Pepper.v.1.5.chr01 232997679 1e-151
CaES4476 Pepper.v.1.5.chr01 233433713 2e-93
CaES2485 Pepper.v.1.5.chr01 233433809 2e-64
CaES3368 Pepper.v.1.5.chr01 235771611 1e-115
CaES4559 Pepper.v.1.5.chr01 236922829 1e-125
CaES0991 Pepper.v.1.5.chr01 237766443 1e-102
CaES3529 Pepper.v.1.5.chr01 243025794 1e-83
CaES0895 Pepper.v.1.5.chr01 243834487 1e-102
CaES1792 Pepper.v.1.5.chr01 243955319 2e-29
CaES4784 Pepper.v.1.5.chr01 244056911 1e-115
CaES2887 Pepper.v.1.5.chr01 244440095 4e-87
CaES4514 Pepper.v.1.5.chr01 244440266 1e-104
CaES4747 Pepper.v.1.5.chr01 244440269 1e-139
CaES5040 Pepper.v.1.5.chr01 244440660 3e-34
CaES1111 Pepper.v.1.5.chr01 244536336 1e-125
CaES4500 Pepper.v.1.5.chr01 244537069 2e-48
CaES1225 Pepper.v.1.5.chr01 245292006 1e-103
CaES3986 Pepper.v.1.5.chr01 245571111 1e-119
CaES4067 Pepper.v.1.5.chr01 245651374 5e-68
CaES4923 Pepper.v.1.5.chr01 246122090 4e-26
CaES5603 Pepper.v.1.5.chr01 246227582 3e-61
CaES1990 Pepper.v.1.5.chr01 246744251 1e-119
CaES3408 Pepper.v.1.5.chr01 246800173 1e-124
CaES4771 Pepper.v.1.5.chr01 246817641 1e-142
CaES3251 Pepper.v.1.5.chr01 248476908 1e-119
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


MarkerDB | Capsicum annuum