Radish Marker Database

B. rapa genome (v1.2) list : A03

Order of Daikon markers and B. rapa gene models

Daikon markers on the B. rapa genome (v1.2)

Total Entries: 519


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name Genome
(B. rapa v1.2)		 Evalue GHRI
Name Position* Linkage Position
RSS0105 A03 883752 9e-49
RSS2937 A03 884510 6e-47
RSS0150 A03 905231 5e-63
RSS2877 A03 910083 8e-57
RSS2054 A03 915814 3e-78
RSS0164 A03 930171 1e-135
RSS0622 A03 973755 1e-48
RSS3529 A03 1040812 0.013
RSS0354 A03 1239538 3e-35
RSS3580 A03 1274059 1e-126
RSS0395 A03 1277188 2e-30
RSS0932 A03 1278041 2e-59
RSS2627 A03 1553632 2e-99
RSS2307 A03 1554451 1e-100
RSS3103 A03 1595969 1e-140
RSS4033 A03 1629124 1e-114
RSS2059 A03 1687030 2e-62
RSS0611 A03 1692397 6e-49
RSS3763 A03 1851413 2e-79
RSS1858 A03 1911768 1e-115
RSS2169 A03 1912047 3e-48
RSS0774 A03 1936691 5e-50
RSS2670 A03 2055830 9e-63
RSS3455 A03 2082869 4e-36
RSS0055 A03 2115863 1e-89
RSS1185 A03 2126250 1e-122
RSS2067 A03 2229387 3e-68
RSS1717 A03 2314675 1e-86
RSS1733 A03 2378310 1e-88
RSS2235 A03 2428187 4e-08
RSS1997 A03 2485053 5e-94
RSS1384 A03 2526334 1e-114
RSS0167 A03 2556280 1e-106
RSS2688 A03 2722554 3e-95
RSS3967 A03 2729769 2e-67
RSS3726 A03 2820023 8e-82
RSS2676 A03 2892518 2e-45
RSS1305 A03 2918027 7e-87
RSS2820 A03 2936641 6e-58
RSS3816 A03 3073872 1e-128
RSS1943 A03 3090330 1e-44
RSS0678 A03 3090787 4e-08
RSS2530 A03 3122735 4e-88
RSS0510 A03 3139361 1e-119
RSS3170 A03 3188961 2e-49
RSS3630 A03 3358319 1e-91
RSS3383 A03 3497066 2e-72
RSS0725 A03 3497066 2e-43
RSS3923 A03 3500087 9e-75
RSS2166 A03 3504851 2e-75
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 519

MarkerDB | Raphanus sativus